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 除部分潜育程度浅的潜育性稻田潜育层似块状结构、棱柱状结构外，凡潜育程度探的稻田，如烂锈田、深脚烂泥田等，均出现浮泥层，该层土粒分散，呈稀糊软烂状，无结构可言。浮泥层距地表深浅不一，浅者不过数厘米；此层厚度有厚有薄，厚者有1米以上。如果此层距稻田表面浅，且厚度大，将造成人畜耕种不便，稻秧不易扎根，飘秧严重，返青慢，常坐克，产量低。这是改良潜育性稻田最关键、最彻底的办法。通过开深构排水，能较快地提高土温和泥温，增强土壤的氧化能力，减少或消除毒物危害，同时土壤的其他理化性状，如土壤有效养分、土壤结构也相应地得到改善。开深沟排水的开沟方法有明沟和暗沟两种，以暗沟为好。这是较好地利用潜育性水稻田的方法。稻田起垄，改变了微地形，位田中积水由垄沟排出，在大气蒸发作用下，产生至垄构向垄埂的毛细管上升水，空气也能进入土体，从而改善土壤通透性，降低还原物质含量，提高土温，协调水、气、热、养分状况。