种苦瓜的菜农普遍采用的追肥方式是随水冲施，这样虽然很方便，而且能把肥料均匀地施入土壤中，但苦瓜采用这种方式追肥不可取。原因是苦瓜亩种植株数较少，每亩只有200～300株，每行只有3～6株，若采取随水冲施方式追肥，肥料利用率会很低，浪费严重。
因此，苦瓜追肥应改为集中施肥，如挖环状沟施肥等，这样可大大提高肥料的利用率。
具体方法是在苦瓜植株内侧20厘米处挖一条环状沟，沟深5厘米，然后每沟施入复合肥50克或生物肥80克，用土埋沟后浇水。也可在苦瓜植株内侧20厘米处挖一条半米长的条状沟，每沟施入上述数量的肥料，效果也不错。需要注意的是，苦瓜每次追肥后，应当及时浇水，这样吸收效果才更好。
