1.合理轮作
由于病菌可以在土壤中越冬，合理轮作可以减少土壤中的病菌。打瓜不能重茬、迎茬以及和其它葫芦科作物连作，轮作不应少于4年。前茬以小麦、油料、玉米、豆类等作物最好。种植地应选择土壤肥力高、酸碱适中、土层深厚、通透性良好、灌排方便的壤土或砂壤土为宜。
2.种子处理
选用籽粒饱满、板平片大、黑白分明、适应性强、纯度≥95%、净度≥99%、发芽率≥95%、水分≤10%的优良品种，如内蒙黑中片等，播前精选种子，晒种2～3天后，用萎福+噻虫嗪+闪电生根壮苗剂种衣剂拌种，
3.栽培模式
采用膜下滴灌栽培或者开沟起垄（深沟高垄）栽培。前者配置为：采用70厘米地膜，行距50＋130厘米，株距17厘米，滴灌带位于50厘米窄行内，一膜一带，平均滴灌带间距180厘米。后者配置为1.45米宽膜，行距60＋120厘米，株距17厘米，开沟、覆膜、播种一次完成。合理密植，667平方米保苗3000～3500株，不宜太密，防止茎叶郁闭。
4.科学灌溉
应根据土壤、作物需水特点、天气状况等进行科学灌溉。采用滴灌或者细流沟灌，严禁大水串灌、漫灌，灌溉时达到垄不漫水、沟不积水、根颈不淹水的要求。毛渠间距为30～50米，不宜太长，防止灌水不均。灌溉时间以早上或者晚上为宜，高温天气中午不浇园。此外，7～8月份，雨量较大的时候，及时做好排水工作，防止田间积水。
5.药剂防治
及时进行药剂预防是控制打瓜疫病发生蔓延的有效措施。由于疫病潜育期短，蔓延速度快，危害程度大，在发病前要喷药预防，特别是每次大雨后应及时喷药1次，以后每隔5～7天喷药1次。药剂防治可采用霜脲锰锌、乙铝锰锌喷药防治，可以结合叶面肥进行，以降低成本。
