山东圣丰种业联手科研单位启动中国花生基因组计划
林运跑 本报记者 梅隆
由山东圣丰种业科技有限公司牵头,广东省农业科学院作物研究所、山东省花生研究所、Macrogen千年基因以及美国、印度、巴西等专家共同参与的中国花生基因组计划在“第十一届中国专利高新技术产品博览会”上举行了签约仪式,目前已全面启动。该项目计划于全球范围内首次完成对花生A基因组的全基因组测序、组装及序列结果的注释。
“第十一届中国专利高新技术产品博览会”是由国家知识产权局、科学技术部、中国科学院、中国工程院、山东省人民政府共同主办的一次科技盛会,不久前在山东省济宁市曲阜孔子文化会展中心举办,共有27项合作项目在本次会议中成功签约,作为将对中国农业的发展产生深远影响的花生基因组计划,在本次会议中得到了相关部门的广泛关注和大力支持。
据了解,花生(ArachishypogaeaL。)是世界上重要的油料作物和优质植物蛋白源之一,我国的花生种植面积仅次于印度,总产位居世界第一。完成花生基因组的测序及遗传密码解析,将对花生的遗传育种及新品种改良具有重要的战略意义。此外,作物种质资源是国家生存和发展的战略性资源,作物种质资源保护是生物多样性保护的重要内容。由中国科学家启动中国花生基因组计划,将有利于对我国花生种质资源的保护。
据专家介绍,花生栽培种(AABB)是异源四倍体,基因组由A基因组和B基因组组成,采用目前的测序技术直接进行测序组装是很困难的,容易造成序列拼接错误。前期研究结果表明,花生A基因组与B基因组的相似度达98%,A基因组所含的优质基因与B所含的优质基因基本是一致的。因此,仅对花生A基因组进行测序即可挖掘相当数量的优质基因并开发大量分子标记,从而将研究结果应用于花生分子育种。
本项目的发起人之一、广东省农科院梁炫强教授表示:“花生全基因组测序的结果将为其遗传改良提供重要的数据资源和平台,有助于科研人员从分子水平了解花生的生长、发育及繁殖过程,并对花生新品种的培育以及提高花生的产量、品质和抗病性等具有重要的意义。”国家花生产业技术体系首席科学家禹山林研究员以及本项目的主要资助企业山东圣丰种业公司的副总裁兼科研总监李洪杰也表示:“本项目仅是花生基因组研究的开始,后期我们将开展更多的花生基因组重测序和花生转录组测序以及花生B基因组和AABB基因组的测序,从而深入地揭示花生的遗传多样性及基因表达调控模式。”
在签约仪式上,Macrogen的中国项目总监于越说:“很多植物基因组因为重复度和杂合度较高,对全基因组的序列组装提出了巨大的挑战。本项目的实验和分析工作将全部在Mac-rogen的标准实验室完成,我们计划将结合多种测序平台来完成花生基因组的组装,根据Macrogen大量的全基因组项目执行经验以及通过结合各测序平台的优势,有信心得出花生基因组高质量的序列图谱。”
山东圣丰种业科技有限公司是以大豆(4835,32.00,0.67%)、花生、棉花(19375,-145.00,-0.74%)、小麦(2475,-31.00,-1.24%)种子为主导产业的国家重点高新技术企业,获农业部“育繁推一体化”认定,属国家一级资质,并获农业部转基因种子生产、经营许可证。企业下设科研中心、人力资源、财务中心、4个专业公司和北京、黑龙江、济宁3家分公司及新疆圣丰种业、北京通州区金圣丰生物高科两家全资子公司。公司科研中心建有实验楼、种质资源库等基础设施近万平方米,设有分子、抗性等7个完善的育种实验室,并在全国范围内实施开展“24423育种工程”,即为2大育种中心、4大育种站、4大联合育种实验室及23个试验点构建了覆盖全国的科研育种网络。