由中国农业科学院棉花研究所主持,深圳华大基因研究院、北京大学等单位共同完成的二倍体棉花-雷蒙德氏棉的全基因组草图于8月26日发表在国际权威学术期刊《自然-遗传学(Nature Genetics)》,标志着我国棉花基因组学研究取得了国际领先的地位。
棉花是全球最重要的经济作物之一,也是纺织工业主要的天然原料,还是一种研究多倍体化、细胞伸长和细胞壁生物合成极好的模式系统。目前,陆地棉占棉花种植面积的90%以上,而雷蒙德氏棉是陆地棉祖先的两个供体种之一。为深入挖掘与利用棉花重要功能基因,加快分子育种和全基因组育种的进程,棉花所所长喻树迅院士发起并主持实施了棉花基因组计划(Cotton Genome Project,CGP)。研究团队采用全基因组鸟枪法结合新一代的高通量DNA测序技术对雷蒙德氏棉进行了全基因组测序,获得了其87.7%的全基因组序列。研究结果表明,雷蒙德氏棉是由其祖先历经多次基因组复制而形成的。
研究发现,基因组包括了40976个蛋白质编码基因,其中,92.2%已得到了转录数据的进一步证实。此外,科研人员还从基因组注释结果中发现了有可能为早期纤维发育所必需的基因。
雷蒙德氏棉基因草图的完成,为进一步解析陆地棉全基因组序列奠定了坚实的基础,有利于棉花优质、高产、抗逆等重要农艺性状的深入研究,将进一步加快优良新品种的培育进程。
农业部副部长、中国农业科学院院长李家洋特地发来贺信。他称赞该项成果的取得为我国在世界棉花基因组学研究方面占得先机,希望研究人员继续加强棉花基因组学研究,并将研究成果应用到培育优良棉花品种上,最终实现基因组水平上的棉花分子设计育种,做到“顶天立地”。(通讯员 冯文娟)