8月12日,美国《国家科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了由中国水稻研究所、深圳华大基因研究院和中国科学院遗传与发育研究所等单位合作的最新科研成果,这篇题为《利用水稻重组自交系的重测序改进亲本基因组序列进而解析超级杂交稻的产量相关遗传位点》(Dissecting yield-associated loci in super hybrid rice by resequencing recombinant inbred lines and improving parental genome sequences)的论文,为超级杂交稻产量相关位点的解析提供了宝贵的材料和有效的途径。
中国的杂交稻为世界粮食生产作出了巨大贡献,作为超级杂交稻标杆组合的“两优培九”以其丰产特性,在生产上大面积种植。中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室的科研人员通过长期努力,构建出132个超级杂交稻“两优培九”的核心重组自交系和1709个用于基因克隆的大规模重组自交系,并与深圳华大基因研究院合作对核心重组自交系进行了基因组重测序,成功构建了一张超高分辨率的遗传连锁图谱。
研究人员首次组装成功具有籼稻和热带粳稻血缘的“两优培九”母本品种培矮64s的基因组序列,并基于高密度物理图谱,不仅更新了“两优培九”父本籼稻品种93-11的基因组序列,还结合12个水稻产量性状的考查共检测到43个与水稻产量密切相关的数量性状位点(QTL),其中包括20个尚未报道的新QTL。同时,利用大规模重组自交系群体,结合亲本基因组间大量精确的单核苷酸多态标记(SNP)和插入缺失标记(InDel)对两个控制穗粒数和二次枝梗数的QTL——qSN8和qSPB1分别加以精细定位,最终确定控制抽穗期和穗粒数的DTH8基因和控制穗分支的LAX1基因为候选基因,其中qSN8通过互补实验证实为DTH8基因。这一大规模重组自交系群体与超高分辨率遗传图谱相结合,其一系列新的产量相关基因将会被陆续克隆和开展功能研究,从而为进一步阐明超级稻产量的遗传基础和基因辅助育种搭建了理想平台。(通讯员 章蓉蓉)