棉花苗期病害主要有立枯病、炭疽病、红腐病等，主要防治措施有以下几点：
1、精选种子，用种衣剂包衣：选择不带病菌，成熟度好的棉种，在播种前选用适合当地的种衣剂对种子进行包衣，选晴天晒7天左右，增加后熟，提高出苗率和出苗速度，减少病害发生。
2、适时播种：以5厘米深土温达12℃时为适宜播期，播深2-3厘米为宜。
3、加强苗期管理：①适当早间苗、勤中耕，降低土壤湿度，提高土温，培育壮苗。②苗期喷药防治：棉花出苗后喷洒50％多菌灵或70%甲基托布津可湿性粉剂800倍液+70%代森锰锌600倍液。
