日前，深圳农业基因组研究所（以下简称“基因所”）的最新研究成果，在线发表于权威学术期刊《NatureGenetics（自然·遗传学）》杂志上。基因所通过对360份番茄种质全基因组的分析，阐明了番茄驯化和育种的基因组学历史，为番茄生物学研究提供了新的工具，奠定了番茄全基因组设计育种的基础。这项研究是我国在番茄研究方面继2012年完成番茄全基因组序列图的绘制后另一重要成果，极大推进了番茄基因组研究的进程。
据该研究团队主要负责人黄三文研究员介绍，番茄起源于南美洲的印地斯山脉，随着人类迁移经由北美洲传到欧洲，逐渐扩散到世界各地。如今番茄的品种多样，是世界范围内普遍种植的第一大蔬菜作物，每年全球市场总价值达550亿美元。同时，番茄也是植物遗传、发育和生理研究的重要模式系统。我们日常食用的大果栽培番茄是由野生番茄驯化而来的，野生番茄果实非常小，只有1克~2克重，经过长期的人工驯化，现代栽培番茄的果重是其祖先的100多倍。然而，番茄果实变大的人工驯化过程一直缺乏全面研究。
因此，基因所借助最新配置的超算平台进行基因组大数据分析，发现番茄果实变大经历了从野生醋栗番茄形成樱桃番茄，最终成为大果栽培番茄的两步驯化过程，分别有5个和13个基因受到了人工定向选择。同时，发现了加工番茄（主要用于番茄酱加工）的主要基因组特征，阐明了粉果番茄形成的原因。这些研究成果为番茄育种提供了有效的分子工具。
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