继转基因水稻和转基因大豆之后，转基因玉米也被指出存在非法种植现象。
2015年1月6日，环保组织绿色和平发布调查报告称，在辽宁省多个中国玉米主产区出现了未经国家批准的转基因玉米，在当地已经遍布种子销售、种植、粮食收购及市场流通等各个环节。
中国的转基因玉米都来自进口，多用于饲料，严禁进入食品流通环节。国内自产的转基因作物，只有转基因棉花和转基因木瓜，除此之外，非试验用途的转基因作物种植都是违法行为。
此次国内突然被爆有大面积转基因玉米种植，立即在业内掀起了泾渭分明的两种观点论战：反对者认为，偷种转基因作物是重大丑闻，政府应严厉监管，出重手打击非法种植转基因的现象；支持者则认为，转基因技术是未来农业的发展方向，政府目前在转基因作物的商业化种植上不作为，农民偷种转基因作物是市场的选择。
无论此事件最终以何了局，监管部门都绕不过去一个槛，即不能一味靠“堵”来处理目前的转基因发展困局。
谁是检测方
2015 年5 月至12 月间，绿色和平食品与农业项目主任张菁和同事多次前往辽宁实地调查。
绿色和平的调查大致分为三个阶段，即种子销售环节、种植环节和流通环节。
2015年5月，绿色和平在辽宁锦州市黑山县、沈阳市的法库县和新民市的种子市场，收集玉米种子样品7个，并送往第三方实验室进行转基因成分检测。结果显示，7个样品中有6个样品含有非法转基因成分。张菁告诉《财经》记者，最初的线索来自一些记者和当地农民，知名反转基因人士崔永元也提供了一些帮助，在种子中发现转基因成分，明确了种植实地调查方向。
三个月后，绿色和平前往黑山县、康平县、法库县、新民市以及彰武县等五地的玉米种植区实地调查，在通往各县市的省道和主要干道两侧的玉米大田中随机采样，采样范围涉及30个村镇，共收集玉米样品45个。结果显示，其中42个样品含有转基因成分，比例高达样品总量的93％。
在随后的9月至11月间，绿色和平走访了调查区域的中储粮库、玉米私营收购企业、杂粮批发市场和上述五个县市及其周边城市的超市，从大型杂粮批发市场和当地大型超市随机购买了21个玉米制品样品，实验室检测结果显示，其中20个样品检出了转基因成分。
张菁称，上述数据让她“震惊”。目前，中国没有批准任何一种转基因玉米进行商业化种植，但调查结果显示，辽宁的转基因玉米“滥种”现象非常严重。
对于本次调查中的检测机构，绿色和平方面表示不方便公开具体信息，只强调是“有资质的第三方实验室”。
转基因检测需要在农业部认证的农业转基因生物检测机构检测，出具报告才具有权威性。
按《农业转基因生物安全管理条例》规定，农业主管部门可根据安全评价工作需要，委托具备检测条件和能力的技术检测机构对农业转基因生物进行检测。
在看过绿色和平的公开报告后，中国科学院遗传与发育生物学研究所高级工程师姜韬倾向于认为，绿色和平是用非规范的、初步筛查的方法给出结论，可能不专业、不规范。
转基因的测定是严格的专业测试。必须由专业人员取样、封装、记录直至测试，全程规范。此外，若是正规实验室检测出含有转基因成分的玉米有如此高的比例，也有可能是取样过程中发生了转基因污染。比如，盛放过转基因大豆的麻袋，再去装玉米，就会测出玉米含有转基因。
姜韬介绍，一次规范的转基因成分定量检测，花费在3000元以上；若采用快速检测转基因的试纸，平均一次费用是五六十元，但试纸法既不能准确定量，也不具有判决性的定性作用，只能用来初步筛查。
绿色和平公布的送检样品数目为73个，若全部采用规范的定量检测，则检测费用在20万元以上。张菁同样不肯透露检测费用。
中国农业科学院生物技术研究所研究员黄大对《财经》记者分析，按照《农业转基因生物安全管理条例》，转基因的检测要由第三方检测机构来进行，绿色和平没有公布他们的报告是谁做的，不具有公信力。
绿色和平食品与农业项目经理李一方表示，以前曾公布过国内第三方实验室的报告，但随后该实验室就受到政府部门的施压，故而现在都与第三方实验室签署保密协议。
农业部尚未就此事件做出回应。1月7日，辽宁省农村经济委员会办公室工作人员张江对《财经》记者解释称，以前没接到绿色和平组织的举报。现在省农委已经派出了5个工作组到报告中提到的县市，同时邀请农业系统的工作人员与农户协助进行调查，调查出来后将严格按照相关法律法规进行处理。2015年就调查出有农户非法种植转基因玉米，已经在上报农业部后进行了相应的处理。
他介绍，监管重点在种植与种子入库阶段，发现疑似转基因作物或者种子后，会交到农业部认证过的专业检测机构进行检测。
谁应受罚
2015年10月，康平县和法库县的一些种子店在“试验田”上召开现场会，绿色和平的工作人员也跟随销售人员进场。“试验田”通常是种子店老板自己或亲戚家的几垅玉米地，里面种植着店里招牌的转基因玉米种子。销售人员向前来参观的村民宣讲转基因玉米如何“抗虫”，好管理。
抗虫和抗除草剂，是全球已商业化的转基因作物最受推崇的两大优势。绿色和平此次检出的转基因玉米品种主要为Mon810、NK603、Bt11和TC1507，均为抗虫、抗除草剂或者二者兼具的品种。
这四款转基因玉米均为全球市场上主要的商业化转基因玉米品种，目前中国只批准进口做加工原料。生产商包括美国孟山都公司、杜邦先锋和陶氏公司，以及瑞士先正达公司。
绿色和平未能查到这些转基因玉米的来源。一位跨国种业公司的亚洲区生物技术总监表示，绿色和平提到的几个县，确实是转基因玉米非法种植比较多、而且时间比较长的县。这些县每年都有公开的现场会，向农民推介转基因玉米种子。最大可能是不法分子从转基因试验田中盗种，然后非法制种，私自售卖。
如果细心的话，甚至可以粗辨出转基因玉米植株，它的叶子更光滑漂亮。一位中外合资农业公司的市场总监也向《财经》记者证实，辽宁市场上的转基因玉米比较盛行，其他如河南、山东等玉米种植大省目前没有转基因玉米。
转基因作物与普通作物相比，可以降低农民的生产成本，大大减少除草、打药等农业劳作，并且在遭遇虫害时保持作物稳产。据上述生物技术总监说，尝到种植转基因作物甜头的辽宁当地农民，“哭着喊着要种转基因抗虫玉米种子”，以致该公司原来在辽宁主打的常规杂交玉米种子销量大幅下滑。
巴西也曾经历同样的事情。阿根廷在南美洲最早开始种植转基因大豆，而巴西由于法律法规上的矛盾，一直没有批准种植。巴西农民看着邻国的同行富了起来，心有不甘，就从阿根廷偷运种子回来种，到2004年前，与阿根廷交界的巴西农民普遍偷种转基因大豆。之后，巴西政府放开管制，时任总统卢拉签署法令，允许使用转基因大豆，此后修订法律，解决转基因作物种植问题。
在中国批准种植转基因玉米之前，商家非法生产和农民“偷种”的行为都是违法的。在现场会上，也有农民质疑种植转基因玉米的合法性，销售人员则声称，所售种子是经国家批准可种植的，经过辽宁省的审定。
根据《农业转基因生物安全管理条例》，未经批准的转基因生物，或者未按照批准的品种、范围、安全管理要求和技术标准生产、加工的，农业主管部门可依据职权，责令停止生产或者加工，没收违法生产或者加工的产品及违法所得。同时，违法所得10万元以上的，并处以违法所得1倍以上5倍以下的罚款；没有违法所得或者违法所得不足10万元的，并处以10万元以上20万元以下的罚款。
北京市京悦律师事务所高级合伙人、律师王少华告诉《财经》记者，如果后期调查绿色和平报告所言属实，确实存在非法种植转基因玉米的行为，种植者本身不会承担法律责任，但要追究种子销售者的法律责任。
其实，黄大也相信在国内有一定程度上存在非法偷种转基因农作物的现象，但他认为“这是难免的，是市场的选择，农民肯定倾向于优质的作物种子。即便是存在非法种植、销售的状况，监管部门也不能一味只靠‘堵’来处理目前的困局，要疏堵结合，才能结束现在的转基因农作物种植乱象”。
黄大表示质疑绿色和平组织此次所谓调查的合法性。对此，王少华则认为，绿色和平组织在民政部门没有登记注册，因此没有权利进行这样的调查活动，如果农业部门调查后证实并不存在该组织报告中所说的状况，该组织的行为可能违反《治安管理处罚条例》与《刑法》，涉嫌编造、故意传播虚假恐怖信息罪。
