大葱的主要病害是紫斑病、葱锈病、软腐病等；主要的虫害是葱蓟马、潜叶蝇、甜菜夜蛾等。
1、紫斑病主要为害叶和花梗。初呈水渍状白色小点，后变淡褐色圆形或纺锤形稍凹陷斑，继续扩大呈褐色或暗紫色。温暖多湿的夏季发病重，老苗、缺肥田块发病重。防治：轮作；发病初期用百菌清500倍或杀毒矾500倍或扑海因1500倍喷雾。7—10天1次，连续3—4次。
2、葱锈病主要为害叶、茎、花梗。初呈橙黄色或黑褐色疮斑，后散出橙黄色或暗褐色粉末。我县葱锈病多发在春季留种田。
气温低的年份、肥料不足及生长不良发病重。防治：施足有机肥，增施磷钾肥；发病初期代森锰锌1000倍或百菌清500倍液喷雾。10天1次，连续2—3次。
3、大葱软腐病由细菌引起，高温高湿、机械伤、虫口伤容易引起病害流行。病害症状为大葱地上部分倒伏，容易拔起，茎下部腐烂，并有恶臭。
防治：保持田间排水畅通，雨后不积水；及时防治害虫以防传病，培土时避免损伤大葱。药剂可采用77%可杀得500倍液、72%农用硫酸链霉素4000倍液防治。
4、葱蓟马 成虫体长1.2—1.4毫米，为害葱的心叶、嫩芽，叶上出现小白斑。防治：用10％吡虫啉2000倍液防治。
5、潜蝇 以幼虫在叶肉组织内蛀食，啃食叶肉，造成减产和品质下降，同时又传播病害。本地区在5月中旬至10月底均有危害。
防治：2％阿维菌素3000液防治。用药时间以上午为宜。
6、甜菜夜蛾，5%甲维盐防治。
