农业科技创新联盟由吉林省农业科学院发起，联合辽宁省农业科学院、黑龙江省农业科学院、内蒙古自治区农牧科学院、黑龙江农垦科学院共同组建。东北区域农业科技创新联盟旨在整合东北地区农业科技创新资源，搭建区域农业科技创新与交流平台，针对东北地区玉米秸秆综合利用的瓶颈问题，凝聚优势科技力量，通过不同地域、不同学科、不同环节的协同创新，形成“集团军式”的研发模式，解决区域农业发展中的重大科学问题和共性关键技术。
多年来，人们试图将秸秆和人畜粪便通过沼气发酵处理，但因冬季气温过低而难以实现。吉林省农科院农村能源与生态研究所专家经过多年摸索，成功研究出一整套沼气发酵新技术。利用该技术可以使大量秸秆和人畜粪便进行沼气发酵，不仅解决了农村污染源治理问题，还能化害为利、变废为宝，为我国北方循环农业发展提供了一条新路。
吉林省农业科学院院长吴兴宏在大会上介绍，秸秆作为原料、饲料、燃料，综合利用最大的问题是秸秆收集、运输和储藏。为此，吉林省农科院提出“龙头企业+合作社+农民”的解决方式，培育秸秆收储运新型经营主体。探索建立以秸秆机收打捆为重点的收储运体系，在试点基础上发挥辐射带动作用，逐步实现秸秆机收打捆全域覆盖。
秸秆还田一直是联盟重点研究课题之一。在直接还田方面，针对东北地区气温低、秸秆腐解难度大等问题，吉林省农业科学院提出以“深翻还田为主，多种方式并存”的全程机械化玉米秸秆直接还田技术体系。同时依托国家“一带一路”发展规划，从俄罗斯引进可在低温条件下快速分解植物残体、具有改良土壤特性的木霉菌，从根源上破解了东北地区秸秆还田入土后不易腐解的技术难题。2015-2016年，该技术体系在东北中部公主岭市、松原市等地累计推广20余万亩，社会效益和经济效益显著。
在秸秆能源化利用方面，辽宁省农业科学院提出了玉米秸秆厌氧倒置层燃技术，研制出“三省”（省钱、省料、省事）生物质取暖锅炉，并获得国家专利，该锅炉目前已“走进”2000多农户家中。
