一、品种因素转基因抗虫棉，早熟性和结铃性突出，产量较高，易管理，但对土壤质地和水肥投入要求较高，抗逆性差，中后期早衰现象严重。另外，棉花是常异花授粉作物，保纯难度较大，品种种性的退化也是导致棉花后期早衰的一个重要因素。
二、肥料因素
1.不施有机肥。不施有机肥，只施化肥，土壤有机质含量下降，造成土壤板结，土壤供肥能力下降，营养失衡。
2.钾肥使用量较小。棉农对氮磷肥投入较大，钾肥不施或使用较少，而抗虫棉对钾敏感，缺钾会诱发红叶茎枯病等生理性病害，导致棉花早衰而减产。
3.根外追肥。中后期棉花根系老化，吸收能力减弱，需根外追肥，补充氮、磷、钾、硼、锌等营养元素，才能保障棉株正常的生长发育。多数棉农不习惯叶面补肥，或是等到棉田早衰症状明显时才进行———根外追肥过晚。
三、连作重茬因素。棉农轮作倒茬困难，多年连作，形成结构性营养元素缺乏，积累大量病菌，病害逐年加重。特别是枯、黄萎病的暴发，严重阻碍棉花的生长发育，产量损失严重。
四、地膜棉田播种偏早 部分棉农习惯早播，播种过早，易遇到低温、晚霜危害，引发苗期病害。而且早播会使伏前桃过多，棉田过早转入生殖生长与营养生长并重阶段，生殖生长需要营养较多，营养生长受到影响，棉株生理负荷过重，植株抗性降低，难以搭成丰产架子，形成“早老棉田”而早衰。
五、水分因素 高温干旱，棉花根系抗逆能力差，暴雨或大水漫灌，地温骤降，根系缺氧呼吸产生有毒物质，降低根系活力；同时，会传播病菌，引起枯、黄萎病蔓延暴发，加重早衰。
六、田间管理因素
1.全生育期不揭膜。棉农习惯性不揭地膜，前期表层水分较多，根系下扎浅，没有形成强大根系，影响对深层水分、养分的吸收，抗逆性差；前期水、温、肥条件好，棉株长势旺，吸收消耗养分多，中后期如不能及时补充肥料，易造成脱肥早衰。冬前或春季拾残膜，一般拾膜不到位，遗留田间较多，地膜可在耕层残留30年以上，造成“白色污染”，影响下茬根系生长发育，形成恶性循环。
2.化控技术有待提高。前期不控，或调节剂用量偏小，棉株旺长，形成棉株“高、大、空”，造成下部烂铃增多，脱落严重；后期缩节安用量偏大，叶小节短，铃皮加厚，生长迟滞，影响单铃重。
3.病虫害防治不到位。病害防治重治轻防，本末倒置，防治成本增加，防治效果下降。种植转基因抗虫棉，基本控制了棉铃虫危害，但一些非靶标害虫上升为优势种群，如盲椿象、红蜘蛛、蚜虫为害严重，如防治不及时，会造成上部果枝幼铃大量脱落，棉叶受损，光合能力减弱，有机营养不足，严重影响棉株的生长发育而早衰。
