张掖市农业科学研究院整理收集分类保存近60年以来农科院科技人员分散保存的种质资源23科82属的作物21093份种子（块茎、实体），野生植物标本195份，中药材标本12份，祁连山食用菌标本12份，实现与国家对作物资源信息的集中管理对接，为张掖建成现代农业大市提供农作物种质资源保障。
近年来，该院投资185万元，建成库存总容量984平方米的种质资源库。收集保存小麦、玉米、胡麻等作物种质资源2万多份。与中国农科院下属各研究所、中国农业大学、金源种业等100余家科研机构和企业合作，在院本部建立原始创新基地326亩，同时每年在海南、东北等地建有异地种质资源鉴定圃，共完成科研及推广项目301项，育成玉米、小麦、甜菜、谷子等农作物新品种116个，获国家、省、部级奖励90项。现已拥有一批优良的稳定自交系和遗传基础广泛的高代二环系，有的已成为本所杂交种选育的骨干自交系，历年记载、考种结果完整。同时，利用ACCESS2007软件对保存的常用自交系及种质资源建立内容涵盖农艺性状、产量、品质、抗病虫性、图片、组合方式、优势类群等相关信息，并开发出亲缘及利用情况检索系统，为本项目顺利实施提供了保障。至目前，共收集整理各类种质资源21093份。其中，新收集保存种质资源4304份；收集张掖市田间杂草195份，为建成张掖市田间杂草谱作了基础性工作；种质资源整理、鉴定后生成二维码共享识别1900份；收集保存珍稀物种：胭脂桃、高挂草、蒙古扁桃（生境地保存）；收集保存乌江贡米黑芒稻、白芒稻等濒危物种5份；更新保活种质资源涉及小麦2500份、大麦97份、大豆139份、高粱45份、红花106份、蓖麻98份。
