小麦全蚀病是一种土传性病害，一旦严重发生是没有有效的药剂可以治疗的。所以应了解其发病因素，做到有效的预防。
小麦全蚀病的发生与栽培管理、土质肥力、整地方式、小麦播期、品种抗性等很多因素有关。
1.连作病重，轮作病轻。如小麦与玉米、谷子等作物1年连作多年连种，增加了土壤中的病菌量，故病情加重；隔茬种麦或水旱轮作可有效控制病情的发展。
2.土壤肥力低病情重。有机质含量高和氮磷钾肥充足的土壤发病轻，主要是因为这些地块有利于小麦生长，从而增强了植株抗病菌侵染的能力和受害后恢复生长的能力。反之，土壤瘠薄，氮磷钾肥比例失调，尤其是缺磷地块，病情就重。
3.感病品种的大面积种植，是加重病情的原因之一。目前豫北地区种植使用的小麦品种还没有高抗小麦全蚀病的，但是，分蘖力强、根系发达的小麦品种较耐病.
4.深翻改土病轻。深翻可加深活土层，有利于小麦生长，同时也可将土表层的病菌翻至底层，从而减轻病害的发生。
5.小麦早播病重，晚播病轻。小麦全蚀病侵染小麦的适宜土温为12℃~20℃，随着播种期的推迟，土壤温度逐日下降，缩短了有效侵染期，因而适期迟播病情减轻。
6.气候的影响。冬前雨水大，越冬期气温偏高，春季温暖多雨等条件有利于该病的发生。
预防措施
1、严格执行检疫制度，不在病区调种子。
2、轮作倒茬，可与甘薯、棉花、绿肥、大蒜、油菜等非寄主作物轮作。有条件的地方可实行水旱轮作。
3、选种抗病品种
4、深翻倒土，增施有机肥料，不用小麦并残体沤肥。
5、药剂防治，小麦播种前用药剂拌种。用种子重量0.2%的2%立克秀拌种，也可用15%三唑醇30g拌100kg种子。小麦播种后20--30天，每亩使用15%三唑酮(粉锈宁)可湿性粉剂150--200g对水60L，顺垄喷洒，翌年返青期再喷一次，可有效预防全蚀病为害，并可兼治白粉病和锈病。
