水稻缺氮时，生长缓慢，植株矮小，叶片发黄。缺氮症状先从下部老叶开始发黄，逐渐扩展到上部幼叶，一片叶先从叶尖开始，后沿中脉扩展至整个叶片。成熟期提早，成穗率低，有效穗少，穗子短，每穗粒数少，产量低。氮肥施用过量时，水稻叶片深绿，肥厚宽大，植株高大、柔软，茎、叶疯长。分蘖大量发生，叶片下披，通风透光不良，易诱发病虫害，甚至发生倒伏。造成水稻贪青晚熟，空秕粒大量增多，导致产量下降。
水稻缺磷时，一般表现为僵苗，稻株生长显著缓慢，稻丛成簇状，不分蘖或很少分蘖。稻苗细瘦，叶片直立不披，叶色暗绿或灰绿带紫。严重时叶片沿中脉呈环状卷曲，叶片萎缩。对于能产生花色甙色素的品种，缺磷会使叶片略带红色或紫色。缺磷植株根的特征是短而细，多为黄根，基本无白根，也无黑根，软绵少弹性，侧根少，且紧夹不分开，严重时根系变黑腐烂。缺磷还延迟抽穗、开花和成熟，且抽穗困难，成熟不一致，穗粒少且不饱满。水稻施磷过量时无增产作用，往往会引起缺锌而减产。
水稻缺钾时，其发病叶片上有褐色斑点，常称为赤枯病。一般刚开始缺钾时，表现为生长缓慢，植株矮小，很少分蘖。老叶褪黄，叶尖有烟尘状褐色小点，发展成褐斑，形状不规则，边缘分界明显，常以条状或块状分布在叶脉间，严重时褐斑连成片，整片叶子发红枯死。发病时，稻株根系受阻，新根少而短，老根细瘦无弹性，褐灰色至黑色，甚至发臭腐烂，病株容易拔起。严重缺钾时抽穗困难，籽粒干瘪、皱缩，节间短，易倒伏。稻株发病表现症状，从下部老叶尖端开始，逐步向叶片基部扩展。水稻施钾过量时没有害处，但也无明显增产效果。
