防止早稻烂秧，除了要精选谷种，催芽整齐均匀；施足秧田基肥，增施磷钾肥，使秧田处于低氮高磷钾状态；做到秧田畦面不渍水；并适时抢晴播种外，还要特别注意秧田水肥管理和彻底防治绵腐病、立枯病的发生。
具体是，播种至起针期，不管天气怎样，都应保持畦面湿润为原则，绝对不能淹灌留水层，以保持氧气充足，提高土温，利于扎根立苗；秧苗开叶后至三叶期，一般仍应以湿润管理为主。遇强寒潮，温度骤降或晚霜天气，可在夜间灌水保温护秧，翌晨洗霜排水换上新水。寒潮过后，应先换新水护秧，然后逐步排水，千万不要马上排水，以免因生理失水造成大量死苗。另外，使用敌克松等杀菌剂可作为抑制和消灭病菌、防治烂秧的辅助手段。
