适时翻沤翻耕不可过早或过迟。一般根据下面两点进行翻耕：一是看绿肥长势，于盛花期翻耕最适宜；二是看对象田，于秧田播种或大田插秧前10~15天翻耕，若翻耕过迟，可能会因绿肥腐烂产生大量硫化氢等有毒物质，而影响秧苗正常生长发育，产生黑根死苗。
浅水翻沤水浅湿度小、氧气多、温度高，微生物活动旺盛，绿肥会分解快、腐烂快。因此，绿肥翻耕应以浅水现泥为宜，翻耕后不可任其风吹日晒，否则会降低肥效，且难于腐烂。
适量翻沤每亩水田施用绿肥量以2000~2500公斤为宜，如绿肥产量较高，可割一部分施到其他田里。翻耕过迟的或鲜草干枯的，应每亩施石灰粉20~30公斤，加速绿肥腐烂。但石灰量不得过多，以免土壤板结和碱性过大而影响水稻生长。曹涤环
